Este Biotopo Protegido se localiza en el centro de la Rioja Alavesa, en las proximidades del amurallado núcleo de Laguardia, desde donde se divisa. Engloba cuatro pequeños humedales: tres de ellos, Carralogroño, Carravalseca y Musco son lagunas temporales endorreicas, de origen y funcionamiento natural, mientras que el cuarto, el Prao de la Paul, es un pequeño embalse creado sobre una antigua zona encharcada.

Las lagunas de Carralogroño y Carravalseca son los últimos ejemplos de una serie de humedales que fueron desapareciendo al ser desecados para su puesta en cultivo. Este sería el caso de la laguna de Musco, drenada, desecada y cultivada hasta su declaración como Biotopo, momento en que se procedió a su recuperación.

Dentro de las aguas habitan plantas y algas que son rarezas mundiales y en los bordes de las lagunas se encuentran herbáceas y juncos adaptados a la salinidad. Densas poblaciones de carrizo cubren amplias áreas, principalmente en Carralogroño, donde encuentran cobijo diversas aves.

Aunque el Biotopo puede ser visitado durante todo el año, es durante el período comprendido entre septiembre y marzo cuando se puede observar un mayor número de aves. Las lagunas de Laguardia son un hito de interés en las vías migratorias de las aves acuáticas ya que, en un período anual, se han llegado a censar hasta 118 especies diferentes de aves, algunas de ellas tan interesantes como el cormorán, el martinete, la garcilla bueyera, el pato mandarín, el morito o la garza imperial. También las hay nidificantes como el zampullin común, el porrón europeo, el rascón, la polla de agua, la focha y el ánade azulón.

El humedal más acondicionado para la visita es el Prao de la Paul, ya que existe un camino que lo bordea y cuenta con zonas e infraestructuras para facilitar la observación de aves.

El entorno del Biotopo posee ciertos rasgos socioculturales que lo diferencian del resto del País Vasco, como el tratarse de una región vitivinícola casi en exclusiva, y poseer una enorme riqueza en yacimientos arqueológicos: Poblado de la Hoya, Dolmen de la Hechicera, enterramientos de San Juan Ante Portam-Latinam, entre otros muchos.